W 1889 roku Josef Manner otworzył w Wiedniu sklep z czekoladą i kawą zbożową. Jego celem była lepsza jakość w uczciwej cenie. Jego motto brzmiało: „Każde dziecko, które wydaje grajcara, powinno dostać nie tylko łakocie, lecz także wartościowy produkt spożywczy”.

Ponieważ jego dostawcy nie dostarczali produktów o oczekiwanej jakości, Josef Manner zdecydował się na samodzielne wytwarzanie czekolady. W 1890 roku, mając 25 lat, kupił niewielką fabrykę czekolady w Wiedniu i został właścicielem firmy „Chocoladenfabrik Josef Manner”.

Dewiza Josefa Mannera brzmiała: „czekolada dla wszystkich”. Na fali sukcesu w 1890 roku dokonał ekspansji, sprzedał sklep i fabrykę oraz przeniósł się do Hernalser Kulmgasse. Do 1897 roku jako fabrykant czekolady zarządzał tam już setką pracowników. O tych początkach do dziś przypomina „chroniona marka Stephansdom”.

Wafle Manner, dzisiaj kultowy produkt, pojawiły się po raz pierwszy w 1898 roku jako „Neapolitaner Schnitte nr 239”. Ich nazwa nawiązuje do orzechów laskowych z regionu Neapolu, budzących skojarzenia z regionem Morza Śródziemnego. Wielkość opakowania nie zmieniła się do dziś.

Josef Manner wcześnie wprowadził do firmy wspólnika: w 1893 roku dołączył księgowy Alfred Teller, który w 1900 roku sprzedał swoje udziały niejakiemu Johannowi Riedlowi. W ten sposób rozpoczęła się trwająca do dziś współpraca rodzin Manner i Riedl.

Pod kierownictwem Josefa Mannera i Johanna Riedla firma stale się rozrastała. W 1904 roku rozpoczęła się rozbudowa fabryki w Hernals, trwająca do 1913 roku. Produkcja prowadzona była częstokroć równolegle z budową, ponieważ popyt rósł szybciej niż obiekt.

Po rozbudowie fabryki i zakupie nowoczesnych maszyn firma Manner stała się liderem rynku w monarchii nad Dunajem. 23 października 1913 r. nastąpiło wejście spółki „Josef Manner & Comp AG” na giełdę. Josef Manner i Johann Riedl kierowali nowoczesną produkcją z udziałem 3000 pracowników.

Josef Manner, założyciel firmy, zmarł w 1947 roku i nie dożył boomu gospodarczego. W latach 60. XX wieku firma Manner wkroczyła w erę technologiczną, wprowadzając szczelne, podwójne aluminiowe opakowanie z czerwonym paskiem ułatwiającym otwieranie – dziś będące klasyką austriackiego wzornictwa.

Po wprowadzeniu nowego opakowania wafle Manner stały się najpopularniejszym i największym produktem w całym asortymencie, w tempie ery samolotów odrzutowych. Już w 1964 roku firma Manner odnotowała kolejny kamień milowy: po raz pierwszy od 1914 roku przekroczono rekordową wysokość obrotów z okresu końca istnienia monarchii naddunajskiej.

W 1970 roku firma Manner przeprowadziła fuzję ze spółką Napoli, Ragendorfer & Co., drugim co do wielkości austriackim producentem słodkości. Dzięki markom Casali i Napoli asortyment rozszerzył się o popularne klasyki, takie jak Casali Schoko-Bananen i Napoli Dragee Keksi.

W 2000 roku do rodziny Manner dołączyła również firma Victor Schmidt & Söhne GmbH oraz jej marki „Ildefonso” i „Victor Schmidt Austria Mozartkugeln”.